ylzzcom永利总站线路检测成果丰硕,亮相2019 WCLC大会
发布时间:2019-10-15由国际肺癌研究协会(IASLC)举办的2019年第20届世界肺癌大会(WCLC)于9月7日-10日在西班牙巴塞罗那盛大召开。全球各地的肺癌和其他胸部恶性肿瘤专家齐聚一堂,展示最新的研究成果,聚焦未来的临床实践走向,共同致力于提升肺癌和胸部肿瘤的诊疗水平。在本届WCLC中,ylzzcom永利总站线路检测与众多国内知名专家医生合作,共有1个oral和20个posters ,研究成果涉及了不同肿瘤亚型的分子变异图谱的全面解析、与疗效预后等临床结局相关的分子标记物的发现以及液体活检新技术的探索等多个领域。话题的广泛性和庞大的发表数量都充分说明了ylzzcom永利总站NGS检测被国内临床界接受的普遍程度,也体现了ylzzcom永利总站线路检测部支持组稿发表全流程的卓越素质。
ylzzcom永利总站2019WCLC发表列表
下面小编将分不同的研究方向给大家详细介绍ylzzcom永利总站在本次WCLC中所展示的精彩内容。
基因变异谱全景分析篇
对肿瘤样本进行全面的基因变异图谱分析,能帮助我们更好的理解不同肿瘤亚型(尤其是罕见亚型)的发生机制,明确驱动基因突变,阐释突变基因如何影响特定肿瘤的生物学特性。基因突变图谱的研究能帮助我们更好地对患者进行分子分型,推动相应的靶向/免疫治疗发展,是精准医疗的关键。在这一篇里,小编为大家详细盘点了本次大会上ylzzcom永利总站展示的4项关于不同肿瘤亚型的基因变异图谱的研究,其中一项入选oral presentation。
Oral: 中国肺大细胞神经内分泌癌(LCNEC)和小细胞肺癌(SCLC)的基因变异图谱分析
OA03.05: Characterization of genomic alterations in Chinese LCNEC and SCLC via comprehensive genomic profiling
研究内容:采用ylzzcom永利总站520基因Panel分别对31例大细胞神经内分泌癌(LCNEC)、35 例小细胞肺癌(SCLC)以及低-中级别的肺神经内分泌肿瘤(14 例类癌和 22 例非典型类癌)的组织样本进行检测并进行突变图谱的分析和对比。结果显示:
- LCNEC和SCLC比类癌具有更高的TP53突变率(p<0.001)。而SCLC比LCNEC(p<0.001, p=0.014)和类癌(p<0.001, p=0.018)具有更高的RB1和PIK3CA突变率。83% 的SCLC和 32.3%的LCNEC携带TP53 和RB1共突变;
- 与SCLC相比,LCNEC在HIF-1和Notch信号传导通路中具有较低的突变频率(p=0.032, p=0.025);
- 此外,LCNEC和SCLC的CNV和TMB显著高于类癌和非典型类癌。
研究亮点:本研究全面展示了肺神经内分泌肿瘤四种亚型的突变图谱以及不同亚型之间的差异化基因组特征。
Poster:非小细胞肺癌脑转移的基因组和甲基化特征
P1.01-18: Integrated Genomic and DNA Methylation Analyses of Non-Small Cell Lung Cancer Patients with Brain Metastases
研究内容:针对27例晚期NSCLC患者的配对肺原发灶和脑转移病灶,分别采用ylzzcom永利总站520基因panel和甲基化测序panel 进行基因突变和甲基化的检测。在肺部原发灶和脑转移灶中分别有370个和 574个突变被鉴定出,其中242个是共有突变。在脑转移特异的突变中,82%为CNV,原发和转移灶共有的CNV只占16%。而SNV 和indel在原发和转移灶中一致性可高达到54%,特别是TP53和其他经典肺癌驱动基因的突变一致性较其他基因更高,可达79%(p<0.001)。TMB 在两种组织中相当(p=0.1)。甲基化分析显示共有268个blocks在原发灶和转移灶中具有不同的甲基化模式,其中211个blocks在脑转移灶中超甲基化,其余的57个则在肺原发灶中超甲基化。这些特异的blocks富集了参与细胞黏连、Rap1和钙信号转导的基因。
研究亮点:该研究展示了肺原发灶和脑转移灶之间不同的突变谱系及表观遗传学特征。
Poster: 罕见肺母细胞瘤的临床病理特征与基因组变异图谱的分析
P1.09-31: Clinicopathological features and genomic profiling of pulmonary blastoma with high-grade fetal adenocarcinoma component
研究内容:本研究针对3例罕见的含有高分化胎儿性腺癌成分(H-FLAC)的肺母细胞瘤进行组织病理学和基因变异谱的分析。结果发现同一个肿瘤的上皮和间叶细胞成分具有分子特征的异质性,同时来自不同患者的相同成分也具有异质性。
研究亮点:本研究展示了一种罕见的肺母细胞瘤亚型的病理和基因组变异特征。
Poster: 中国人群肺淋巴上皮瘤样癌(PLELC)分子突变谱
P2.09-11: Genomic profiling of pulmonary lymphoepithelioma-like carcinoma (PLELC)
研究内容:采用ylzzcom永利总站520基因panel,回顾分析了27例罕见的肺淋巴上皮瘤样癌(PLELC)的基因变异图谱:
- 检测到来自109个基因的184个体细胞变异,包括109个SNV,65个基因拷贝数扩增(CNA),约50%的患者携带CNA;
- 除一例HER2扩增和一例KRAS突变外,其余样本均未检出NSCLC的经典驱动基因变异。PLELC中突变频率最高的基因依次为CCND1(30%)、TP53(26%)、DAXX(22%)和NFkBIA(22%);
- 78%的患者携带表观遗传调节因子相关基因的变异,而51/184个体系突变来自表观遗传调节因子相关基因;
- 与肺腺癌相比,PLELC的TP53突变率更低(26% vs. 68%, p=0.021),与EVB阳性的鼻咽癌相比,PLELC携带更多表观遗传调节因子相关基因的变异;
- PLELC的TMB显著低于肺腺癌,而PD-L1表达阳性率为67%。
研究亮点:研究展示了PLELC患者独特的分子变异谱特征。缺乏NSCLC常见的驱动基因变异和PD-L1的高表达提示免疫治疗可能成为PLELC的潜力治疗策略。
分子标志物探索篇
分子标志物检测对肺癌辅助诊断及肿瘤的疗效预测、预后转归,具有重要临床意义。随着分子生物学和高通量测序的快速进展,越来越多的分子标志物被发现和应用,为临床提供了更多有价值的信息,在帮助早期诊断和个体化医疗等方面提供了新的途径。在本次WCLC中,ylzzcom永利总站线路检测共展示了12项研究,在肺癌的靶向和免疫治疗的疗效预测、动态监控和预后判断等不同领域探索新的分子标志物,为今后的临床应用奠定了基础。小编精选了5项具有代表性的研究成果,为大家详细解读。
Poster: 奥希替尼治疗晚期非小细胞肺癌过程中,ctDNA 动态监控与临床治疗结果的相关性
P1.01-19: Predictive and prognostic values of ctDNA clearance in osimertinib treated advanced non-small cell lung cancer cohort
研究内容:本研究作为药物临床研究(NCT02474355)标志物探索的一部分,针对57例EGFR T790M阳性接受奥希替尼治疗的非小细胞肺癌患者采用ylzzcom永利总站朗清®panel进行检测,分析治疗前和治疗过程中ctDNA的动态变化:
- 基线有检出细胞周期信号通路或P53信号通路基因突变的患者OS较短;
- 在第一次随访时,ctDNA转阴的患者有显著更长的PFS和OS;
- 中位随访时间为168天,有32例患者发生影像学进展。其中,11例患者在影像学进展前出现了分子水平上的进展,比影像学进展平均提前74天。
研究亮点:本研究前瞻性地探索了ctDNA动态监控在T790M阳性接受奥希替尼治疗的中国非小细胞肺癌患者全程管理中的价值:揭示了在第一次随访时ctDNA清零对PFS和OS的预测价值;同时发现在部分患者中可以通过ctDNA监控提前预警病情进展;最后,本研究也揭示了奥希替尼用药前的突变谱特征和预后的关系。
Poster: 在中国晚期非小细胞肺癌患者中探索奥希替尼不同耐药机制与临床治疗结果的相关性
P1.01-91:Clinical outcomes of various resistance mechanisms of osimertinib in Chinese advanced non-small cell lung cancer patients
研究内容:本研究对103例经一代EGFR-TKI治疗耐药后接受奥希替尼治疗的T790M阳性晚期非小细胞肺癌患者,采用ylzzcom永利总站朗清®panel对奥希替尼治疗前及进展后的配对血浆样本进行检测,分析耐药的分子突变谱:
- 携带基线EGFR 19del突变的患者在耐药进展时出现更多的获得性突变,且以MAP/PI3K信号通路和 TP53获得性突变为主。而ERBB2 扩增的耐药机制只在L858R突变的患者中出现。
- 与T790M突变清除的患者相比,持续携带T790M突变的患者PFS和OS显著延长,且发现,持续携带T790M的患者往往存在旁路激活或持续的EGFR激活。
- 以C797S为获得性耐药机制的患者PFS较长,而以MET扩增为耐药机制的患者PFS较短。
研究亮点:本研究揭示了奥希替尼治疗的不同耐药机制,并展示其与预后密切的相关性。
Poster: 甲基化标志物预测早期非小细胞肺癌复发
P2.11-31: DNA methylation markers for prediction of recurrence in stage I non-small cell lung cancers
研究内容:对39例经手术治疗的早期非小细胞肺癌患者的肿瘤和配对癌旁组织进行甲基化测序,通过连锁不平衡分析和统计学模型在基因组上构建甲基化block(MB),并寻找与无病生存期(DFS)显著相关的MB用于构建复发风险预测的模型。最终模型中纳入6个MB,模型C-index为0.729。
研究亮点:本研究建立了基于DNA甲基化的预测模型,能够有效的预测早期非小细胞肺癌复发的风险。虽然还需更多前瞻性研究验证,但该研究初步揭示了DNA甲基化作为分子标志物在临床术后复发监控中应用的巨大潜力。
Poster: 血浆肿瘤突变负荷在非小细胞肺癌中预测免疫治疗疗效
P1.01-36: Clinical potential of tissue tumor mutational burden (tTMB) and blood TMB (bTMB) as a biomarker in non-small cell lung cancer
研究内容:采用ylzzcom永利总站520 panel对28例配对的肿瘤组织和血浆样本进行TMB检测,并在19例接受nivolumab治疗的患者中研究TMB与临床疗效的相关性。我们发现,血液TMB显示出与组织TMB高度的一致性(R2=0.953)。分别以10和16为cut-off,血液TMB高的患者均显示出了更高的客观缓解率(42.9% vs. 0.0% 或66.7% vs. 10.0%)。
研究亮点:该研究显示了血液TMB与组织TMB高度的一致性,并展示了血液TMB作为无创分子标志物,在预测抗PD-1抗体临床疗效中的巨大应用前景。
Poster: 脑脊液cfDNA分子特征可预测肺癌中枢神经转移的临床结局
P2.01-88: Molecular alterations in cerebrospinal fluid predict clinical outcomes of central nervous system metastases in lung cancer
研究内容:对94例肺癌脑转移患者的脑脊液cfDNA采用ylzzcom永利总站朗清®168基因panel检测,分析不同的分子变异与预后的相关性,探索其对预后的预测作用。结果发现:
MET(HR=2.01) 和 MYC 基因变异(HR=2.31)与更短的OS显著相关。
检出多个基因拷贝数变异(CNV)的患者中位OS显著低于检出2个或以下基因CNV的患者(14.9个月 vs. 21.6个月, HR=1.9, P=0.016)。其中检出MET 和 MYC基因CNV的患者OS最短。
在携带多个基因CNV患者中,奥希替尼能显著延长患者的OS(25.8个月 vs 9.2个月, p=0.004)。其中,EGFR 和FGFR1基因 CNV是与奥希替尼获益最显著相关的特征。
研究亮点:本研究揭示了脑脊液cfDNA中CNV基因个数多(>2),特别是MET 和 MYC基因CNV是肺癌脑转移患者的不良预后因素,而奥希替尼能显著延长多基因CNV患者的OS。该研究提示脑脊液cfDNA的分子特征可能可以预测脑转移患者的预后,并为个体化用药提供指导。
液体活检新材料篇
液体活检具有无创、可重复性强、样本获取方便等优点,在肿瘤早期诊断和疾病动态监控等方面有重大的临床应用前景。外周血作为目前液体活检的主要样本类型,虽然具有很多优势,但在检测开发和临床应用方面也面临一系列挑战。因此对于新型液体活检材料的探索,将为临床应用提供更多的选择。ylzzcom永利总站在本次WCLC中展示了两项液体活检新材料的初步研究成果,小编接下来为大家详细介绍。
Poster: 痰液用于肺癌患者液体活检的初步探索
P1.01-21: Sputum can serve as an alternative source for liquid biopsy in patients with lung cancer
研究内容:对11例未经治疗的NSCLC患者的配对FFPE、血浆和痰液样本,采用ylzzcom永利总站朗清®168基因panel进行检测。血浆和痰液的检测结果与FFPE样本的一致率均为61.5%。只考虑有用药指导意义的经典驱动突变,血浆和痰液与FFPE样本的检测一致率分别为82%和91%。研究结果还显示痰液中的肿瘤体细胞突变丰度(AF)要显著高于血浆样本(p=0.039),尤其是在吸烟患者中,差异更加显著(p<0.001)。在血浆和痰液样本中均检出的突变里,92%在痰液中有更高的AF,但在非吸烟患者中,仅有29%在痰液中AF更高。
研究亮点:本研究显示了痰液在晚期NSCLC患者中用于液体活检的潜力。尤其是在吸烟患者中,痰液作为突变图谱分析的材料可能优于血浆。
Poster: 探索肺泡灌洗液作为液体活检新材料在实性肺结节诊断中的应用
P1.11-07: CfDNA from bronchoalveolar lavage fluid for the identification of solid pulmonary nodules: A new medium of liquid biopsy
研究内容:该研究共纳入36例实性肺结节患者。采用ylzzcom永利总站朗清®168基因panel对患者的肺泡灌洗液和配对组织样本进行检测。患者后经手术、气管镜检或胸部穿刺活检确诊。比较基于肺泡灌洗液分子特征的诊断和病理诊断结果的一致性。36例患者中,15例最终病理诊断为恶性结节,16例为良性,5例仍未明。对比病理结果,基于肺泡灌洗液样本的168基因突变谱进行肺结节的诊断,敏感性和特异性分别为80%和75%,PPV和NPV为75%和80%。而使用10个核心基因的突变谱进行诊断,敏感性为75%,特异性和PPV高达100%,NPV为80%。在14例恶性肺结节的患者中,我们比较了肺泡灌洗液与配对组织中突变检测的一致性,发现总共45个突变中,27个在肺泡灌洗液中被检测到,40个在组织中被检测到,检测的一致性为48.9%。
研究亮点:该研究揭示了肺泡灌洗液中的cfDNA可以很好地反映肺癌患者病灶的分子特征,对于实性肺结节良恶性鉴别的特异性高达100%。肺泡灌洗液作为实性肺结节的液体活检的材料显示出初步的临床应用价值。